Начиная с 2026/2027 учебного года, в Академии правосудия внедряется программа прикладной магистратуры по специальности «Судебная деятельность», учебный процесс по которой организован в очной и вечерней формах обучения. Срок обучения по данной магистерской программе составляет один год, по окончании которого выпускникам выдается диплом государственного образца, подтверждающий завершение соответствующего этапа высшего юридического образования. Прием на обучение осуществляется на платно-контрактной основе, при этом стоимость обучения определяется Советом Академии совместно с Высшим судейским советом.

Важной особенностью приема в Академию является то, что на кандидатов не распространяются льготы, предусмотренные законодательством для поступления в другие высшие образовательные учреждения республики. Параметры приема по магистерским программам утверждаются ежегодно Высшим судейским советом на основании предложений Совета Академии. Данная программа направлена на углубленную практическую подготовку специалистов, способных эффективно осуществлять профессиональную деятельность в судебной системе на основе передовых образовательных стандартов.